On the 28th of April 2022, a dozen participants from all over Europe gathered in Pistoia, Italy – one of the most important areas for nursery plant production – to discuss the HOMED-developed tools for the prevention and detection of tree pathogens. The event, organized by IEFC, was led by researchers from the Italian National Research Council and was kindly hosted by the Giorgio Tesi Group, one of the biggest international nursery groups.

During the workshop, researchers presented several tools, among which a portable LAMP and spore traps. The workshop participants were able to discover more about molecular detection methods by partaking in the collection of plant tissues, the sample preparation through DNA extraction and the analysis of the results through the use of a portable LAMP device. This method can be used for the detection of bacteria, insects, phytopoison and viruses but the sampling kit used must be adapted according to the searched pest.

The bacteria Xylella fastidiosa was chosen as the target for the workshop demonstration and, fortunately, no traces of this bacteria were found in the samples taken from the nursery trees. Furthermore, HOMED researchers expanded the scope of the LAMP instrument by designing specific primers for the detection of Fusarium circinatum, Phytophtora ramorum or Gnomoniopsis smithogilvyi. Their participatory demonstration highlighted the simplicity in the use of the tool and its speed (results in only 30 minutes). However, it also showed that the tool is not simple enough to be used stand-alone by nursery technicians.

Additionally, two aerobiological samplers were presented for the monitoring of spores circulating in the air. The results of the samples are to be analysed with a qPCR method to detect the presence of a pathogen. The two spore traps were compared to recognise the benefits of each one and to identify their ideal operating conditions.

Finally, this event was also an opportunity to present the upcoming HOMED Knowledge hub, which will include all the tools and scientific knowledge produced by the project to help our stakeholders in the management of emerging pests and pathogens. The Knowledge hub will be implemented online to continue the demonstration and dissemination of HOMED’s practical solutions for end-users.

Benoît de Guerry (IEFC)

Une dizaine de participants de toute l’Europe se sont réunis à Pistoia (Italie), dans l’une des régions les plus importantes pour la production de plants en pépinière, afin d’échanger sur les outils développés par le projet HOMED, pouvant être utilisés pour la prévention et la détection des agents pathogènes des arbres. L’événement, organisé par l’IEFC, a été dirigé par des chercheurs du CNR et gracieusement accueilli par le groupe Giorgio Tesi (l’un des plus grands groupes internationaux de pépinières).

Pendant l’atelier, les chercheurs ont présenté plusieurs prototypes tel qu’un instrument LAMP portable et un piège à spore. Les participants ont pu en apprendre davantage sur la méthode de détection moléculaire en participant à la collecte de tissus végétaux, à la préparation des échantillons par extraction d’ADN et à l’analyse des résultats à l’aide d’un appareil LAMP portable. Cette méthode peut être utilisée pour la détection de bactéries, d’insectes, de phytopoisons et de virus mais le kit de prélèvement utilisé doit être adapté en fonction de l’insecte recherché.

Heureusement, aucune trace de la bactérie Xylella fastidiosa (choisie comme cible de la démonstration) n’a été trouvée dans les échantillons prélevés sur les arbres de la pépinière. De plus, les chercheurs du projet HOMED ont étendu la portée d’utilisation de l’appareil en élaborant des primers spécifiques pour la détection de Fusarium circinatum, Phytophtora ramorum or Gnomoniopsis smithogilvyi. Cette démonstration participative a mis en évidence la simplicité d’utilisation de l’outil et sa vitesse (résultats en 30 minutes seulement), mais pas suffisamment pour être utilisé de manière autonome par les techniciens des pépinières.

De plus, deux échantillonneurs aérobiologiques ont ensuite été présentés pour surveiller les spores circulant dans l’air. Les résultats des échantillons doivent être analysés par la méthode qPCR pour détecter la présence d’un agent pathogène. Les deux pièges à spores ont été comparés afin d’identifier les avantages et les conditions idéales de fonctionnement de chacun.

Cet événement a également été l’occasion de présenter le centre de connaissances HOMED à venir (« Knowledge Hub »), comprenant tous les outils et connaissances scientifiques produits par le projet HOMED, afin d’aider les parties prenantes dans la gestion de l’émergence d’insectes nuisibles et des pathogènes. Ce centre de connaissances sera mis en ligne afin de poursuivre la démonstration et la diffusion des solutions pratiques, pour les utilisateurs finaux.

Benoît de Guerry (IEFC)

A 28 de Abril de 2022, uma dúzia de participantes de toda a Europa reuniram-se em Pistoia, Itália – uma das áreas mais importantes para a produção de plantas em viveiro – para discutir as ferramentas desenvolvidas pelo projeto HOMED para a prevenção e detecção de agentes patogénicos das árvores. O evento, organizado pelo IEFC, foi conduzido por investigadores do Italian National Research Council e foi gentilmente acolhido pelo Giorgio Tesi Group, um dos maiores grupos de viveiros internacionais.

Durante o workshop, os investigadores apresentaram várias ferramentas, entre as quais um LAMP portátil e armadilhas de esporos. Os participantes no workshop puderam descobrir mais sobre métodos de deteção molecular participando na recolha de tecidos vegetais, na preparação de amostras através da extração de ADN e na análise dos resultados através da utilização de um dispositivo portátil LAMP. Este método pode ser utilizado para a deteção de bactérias, insetos, fitopositivos  e vírus, mas o kit de amostragem utilizado deve ser adaptado de acordo com a praga ou doença pesquisada identificar.

The bacteria Xylella fastidiosa was chosen as the target for the workshop demonstration and, fortunately, no traces of this bacteria were found in the samples taken from the nursery trees. Furthermore, HOMED researchers expanded the scope of the LAMP instrument by designing specific primers for the detection o

A bactéria Xylella fastidiosa foi escolhida como alvo para a demonstração em laboratório e, felizmente, não foram encontrados vestígios desta bactéria nas amostras retiradas das árvores do viveiro. Além disso, os investigadores HOMED expandiram o âmbito do instrumento LAMP, tendo desenvolvido primários  específicos para a deteção de Fusarium circinatum, Phytophtora ramorum ou Gnomoniopsis smithogilvyi. A sua demonstração participativa destacou a simplicidade na utilização do instrumento e a sua rapidez (resultados em apenas 30 minutos). Contudo, mostrou também que a ferramenta não é suficientemente simples para ser utilizada isoladamente por técnicos de viveiros.

Além disso, foram apresentados duas armadilhas aerobiológicos para a monitorização dos esporos que circulam no ar. Os resultados das amostras devem ser analisados com um método qPCR para detetar a presença de um agente patogénico. As duas armadilhas de esporos foram comparadas para avaliar os benefícios de cada uma e para identificar as suas condições ideais de funcionamento.

Finalmente, este evento foi também uma oportunidade para apresentar o próximo HOMED Knowledge hub, que incluirá todas as ferramentas e conhecimentos científicos produzidos pelo projeto para ajudar as nossas partes interessadas na gestão de pragas e agentes patogénicos emergentes. O núcleo de conhecimento será implementado em linha para continuar a demonstração e divulgação das soluções práticas do HOMED para os utilizadores finais.

Benoît de Guerry (IEFC)

El 28 de abril de 2022, una docena de participantes de toda Europa se reunieron en Pistoia (Italia), una de las zonas más importantes de producción de plantas de vivero, para debatir las herramientas desarrolladas por HOMED para la prevención y detección de patógenos en los árboles. El evento, organizado por el IEFC, fue dirigido por investigadores del Italian National Research Council y fue amablemente acogido por el  Giorgio Tesi Group, uno de los mayores grupos internacionales de viveristas.

Durante el taller, los investigadores presentaron varias herramientas, entre ellas un LAMP portátil y trampas de esporas. Los participantes en el taller pudieron descubrir más sobre los métodos de detección molecular participando en la recogida de tejidos vegetales, la preparación de muestras mediante la extracción de ADN y el análisis de los resultados mediante el uso de un dispositivo LAMP portátil. Este método se puede utilizar para la detección de bacterias, insectos, fitoplasma y virus, pero el kit de muestreo utilizado debe adaptarse en función de la plaga buscada.

La bacteria Xylella fastidiosa fue elegida como objetivo para la demostración del taller y, afortunadamente, no se encontraron rastros de esta bacteria en las muestras tomadas de los árboles del vivero. Además, los investigadores de HOMED ampliaron el alcance del instrumento LAMP diseñando cebadores específicos para la detección de Fusarium circinatum, Phytophtora ramorum o Gnomoniopsis smithogilvyi. Su demostración participativa puso de manifiesto la sencillez en el uso de la herramienta y su rapidez (resultados en sólo 30 minutos). Sin embargo, también demostró que la herramienta no es lo suficientemente sencilla como para ser utilizada de forma autónoma por los técnicos de los viveros.

Además, se presentaron dos muestreos aerobiológicos para el seguimiento de las esporas que circulan en el aire. Los resultados de las muestras se analizarán con un método qPCR para detectar la presencia de un patógeno. Se compararon los dos captadores de esporas para reconocer las ventajas de cada uno e identificar sus condiciones ideales de funcionamiento.

Por último, este evento fue también una oportunidad para presentar el próximo centro de conocimiento HOMED, que incluirá todas las herramientas y los conocimientos científicos producidos por el proyecto para ayudar a las partes interesadas en la gestión de plagas y patógenos emergentes. El centro de conocimientos se pondrá en marcha online o virtualmente  para continuar con la demostración y la difusión de las soluciones prácticas de HOMED para los usuarios finales.

Benoît de Guerry (IEFC)